Depende de o que cê instalou no sistema, e como. Os pacotes mais internos do sistema, quero dizer, a parte do "gnu", cê praticamente nunca vai precisar atualizar, então de resto, vai depender do seu ambiente gráfico, e os apps que cê usa. O meu kde ficou o dia inteiro atualizando, simplesmente ksksk O firefox demora umas 2 ou 3 horas de compilação o Libreoffice ficou por umas 3 ou 4 horas.

E fora que, firefox e libreoffice tem pacote binário no repositório do gentoo, pra você não precisar compilar caso não queira, eu por exemplo instalei os binários quanto comecei a instalação, pra ter um sistema usável o quão rápido fosse possível, e depois fui trocando pra as versões compiladas :3

Esses são os mais pesados que me veem a mente agora, mas como o gentoo é bem lento de atualização, tipo um debian, raramente eu preciso atualizar qualquer um deles. Então, de resto, só fica pra atualizar uns pacotes aqui e alí mais levinhos que compilam até rápido, mas no final eu acabo deixando pra compilar tudo a noite, e num fim de semana que daí não importa muito o tempo